Desde 2009, o ENEM passou a incluir também conteúdos específicos de cada disciplina em sua matriz de referência, que antes contava apenas com competências e habilidades. Essa mudança veio junto com várias outras, que no geral tiveram o objetivo de tornar o ENEM mais parecido com o vestibular, já que agora o exame tem essa função. Mas o ENEM avalia competências ou conteúdos? Na minha opinião, esta pergunta parte do pressuposto equivocado de que alguém pode ser competente sem ter informações específicas. Mas isso é outra estória.
Para facilitar a vida do colega professor, coloquei abaixo os conteúdos de biologia do presentes no Edital ENEM 2011, que são os mesmos de 2009. Inseri, por conta própria, uma estrutura de sub tópicos e um índice para facilitar a visão geral. Se quiser, você também pode dar uma olhada nos conteúdos de biologia para Fuvest e Unicamp.